선천적 잠복음경은 음경 뿌리 부분에서 음경피부가 부적절하게 부착되어 있으며, 음경의 끝 부분 피부인 포피가 좁아 귀두의 노출을 방해하기 때문입니다. 후천적 원인은 심한 비만으로 인해 과도한 치골상부 피하지방조직에 음경이 파묻혀 발생하기도 합니다. 또한 포경 수술시에 포피를 충분히 제거하지 않아 남아 있는 피부의 흉터로 인해 귀두가 노출되지 않아 음경이 숨어있는 것처럼 보이는 경우도 있습니다.